cmabios de nombres en algunas variables rlacionadas con microbiota

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...@@ -95,14 +95,6 @@ data_o["Secuenciaciones"] = 0 ...@@ -95,14 +95,6 @@ data_o["Secuenciaciones"] = 0
Total_pacientes = len(data_o.index) Total_pacientes = len(data_o.index)
data = data_o.loc[data_o["incluido"]] data = data_o.loc[data_o["incluido"]]
Total_incluidos = len(data) Total_incluidos = len(data)
secuencias = visitas_datos[0][["id", "muestra"]]
secuencias.set_index("id", inplace=True)
for visita in [1, 2, 3]:
otro = visitas_datos[visita][["id", "muestra"]]
otro.set_index("id", inplace=True)
t = secuencias.join(otro, lsuffix="l-"+str(visita), how='outer')
secuencias = t
secuencias["NSecs"] = secuencias.count(axis=1)
...@@ -118,7 +110,7 @@ vis_sec = { ...@@ -118,7 +110,7 @@ vis_sec = {
"histnorm": "percent", "histnorm": "percent",
#"orientation": "v", #"orientation": "v",
}, },
{ "x": secuencias["NSecs"], "type": "histogram", "name": "Secuenciaciones", "histnorm": "percent"}, { "x": muestras["NSecs"], "type": "histogram", "name": "Secuenciaciones", "histnorm": "percent"},
], ],
"layout": { "layout": {
#"title": {"text": title + " " + etapalab + str(etapaDet)}, #"title": {"text": title + " " + etapalab + str(etapaDet)},
......
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