quitar columnas sobrantes de la funcion get_visit_data

se usará como índice la info proveniente de 'pacientes' que ya
contiene varias de las columnas que vienen en 'visitas', por lo que
eliminan de esta última respuesta.

dinamyc.py

@@ -12,9 +12,12 @@ def get_visit_data(visitnumber):
     yaisons = requests.get(url_visitas).json()["patient_data"]
     yaisons = requests.get(url_visitas).json()["patient_data"]
     df = pd.json_normalize(yaisons)
     df = pd.json_normalize(yaisons)
     df.drop(["tolerance_curve_measure","name","patient_visit_id", "visit_date"], inplace=True, axis=1)
     df.drop(["tolerance_curve_measure","name","patient_visit_id", "visit_date"], inplace=True, axis=1)
+    df.drop(["sex", "age", "height",], inplace=True, axis=1) # estas ya vienen en 'pacientes'.
     lista = [ { cf["controlled_food"]: cf["increment_auc"] for cf in yaison["tolerance_curve_measure"] } for yaison in yaisons ] 
     lista = [ { cf["controlled_food"]: cf["increment_auc"] for cf in yaison["tolerance_curve_measure"] } for yaison in yaisons ] 
     df.rename(columns= lambda x: x.split(".")[1] if "." in x else x, inplace=True)
     df.rename(columns= lambda x: x.split(".")[1] if "." in x else x, inplace=True)
-    #df.drop(["patient_visit_id"], inplace=True, axis=0) #esta etiqueta aparece dos veces: dentro del primer nivel de json y dentro del json de sample
+    df["muestra"] = df["patient_visit_id"] 
+    df = pd.concat([df, pd.DataFrame(lista)], axis=1)
+    return df.loc[df["include_in_analysis"]]
     return pd.concat([df, pd.DataFrame(lista)], axis=1)
     return pd.concat([df, pd.DataFrame(lista)], axis=1)
 
 
 
 
@@ -66,10 +69,10 @@ Total_pacientes = len(data_o.index)
 data = data_o.loc[data_o["incluido"]]
 data = data_o.loc[data_o["incluido"]]
 Total_incluidos = len(data)
 Total_incluidos = len(data)
 
 
-secuencias = visitas_datos[0][["id", "patient_visit_id"]]
+secuencias = visitas_datos[0][["id", "muestra"]]
 secuencias.set_index("id", inplace=True)
 secuencias.set_index("id", inplace=True)
 for visita in [1, 2, 3]:
 for visita in [1, 2, 3]:
-    otro = visitas_datos[visita][["id", "patient_visit_id"]]
+    otro = visitas_datos[visita][["id", "muestra"]]
     otro.set_index("id", inplace=True)
     otro.set_index("id", inplace=True)
     t = secuencias.join(otro, lsuffix="l-"+str(visita), how='outer')
     t = secuencias.join(otro, lsuffix="l-"+str(visita), how='outer')
     secuencias = t
     secuencias = t